自动化学院的前身是1957年筹建、1962年正式挂牌招生的自动控制系，是我国最早设立自动化专业的院系之一，2016年获教育部批准设立了我国首个（当年唯一的一个）“机器人工程”本科专业。

自动化学院以领先的学术水平、严谨的治学学风、雄厚的科研实力位居国家重点学科和一级学科博士授权点行列，在我国控制学界享有崇高的学术地位。学院拥有控制科学与工程一级学科博士点，下设控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、检测技术与自动化装置、系统工程、导航制导与控制五个二级学科博士点和硕士点，其中控制理论与控制工程为国家重点学科。控制科学与工程学科点还设有一级学科博士后流动站与长江学者特聘教授岗位。自动化学院是国家“211工程”和“985工程”建设重点支持单位。2017年入选国家首批“双一流”建设学科，并在第四轮全国学科评估中被评为A类。

自动化学院拥有一流的教学师资队伍，著名控制科学家钱钟韩院士、冯纯伯院士曾长期在学院任教。学院现有教职员工75人，其中正教授24人、博士生导师23人。学院拥有IEEE会士、国家教学名师获得者、长江学者特聘教授、********、国家杰出青年基金获得者、全国优秀科技工作者、科技部中青年科技创新领军人才、中组部万人计划入选者等拔尖人才。学院还拥有国家教学团队，并建有多门国家级精品资源共享课程、精品视频公开课程和江苏省精品课程。

自动化学院每年承担一大批国家级和省部级基础研究和科技攻关项目，在网络控制、智能控制等领域已取得具有国际水平的研究成果，在国际和国内控制学界具有较大影响力。学院面向国家经济建设，积极将科技成果转化为生产力，许多成果已经达到国内领先水平，具有广泛的应用推广价值。学院设有“复杂工程系统测量与控制”教育部重点实验室，近些年来，在基础研究和应用研究领域先后获得国家级和省部级二等及以上奖励数十项，2012年以来获得科技奖八项。一批科研成果在我国控制学界已经产生较大影响，如“基于神经网络逆的软测量与控制技术及其应用”获国家技术发明奖，“多源干扰系统的建模、分析与控制理论研究”获国家自然科学奖，“弧焊机器人装备关键技术研发与应用”获江苏省科学技术奖，学院近年承担的中国南极科考支撑平台项目也产生了较大学术反响。

自动化学院目前设有自动化、机器人工程两个本科专业，设有控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、检测技术与自动化装置、系统工程、导航制导与控制五个研究生专业，并招收控制工程（专业学位）研究生。学院每年还招收一定数量的海外留学生。

自动化学院与美国、英国、法国、日本、澳大利亚等国有广泛的学术交流和科研合作，有十余位国外著名教授与学者受聘为学院的客座教授。学院多次成功举办暑期学校及重要国际学术会议，每年选派若干优秀学生赴海外交流与联合培养，资助学生参加国际学术会议与学科竞赛。