自动化学院历史悠久，底蕴深厚，前身可追溯至1923年国立东南大学电机工程系。学校于1957年筹建自动控制系，1962年正式成立挂牌招生，是我国最早设立自动化专业的院系之一。为适应学科发展，1973年，东南大学动力系“工业电气自动化”专业并入自动控制系，1981年本系“电子计算机”专业分出成立计算机科学与工程系，1987年系统工程研究室分出与校内其他系科合并成立经济管理系，1992年“精密仪器”专业和“检测技术及仪器”专业分出成立了仪器科学与工程系。
学院是国家“985工程”和“211工程”建设重点支持单位。2017年入选国家首批“双一流”建设学科，2022年再次入选“双一流”建设学科名单，在第四轮全国学科评估中获评A类。设有“控制科学与工程”一级学科博士、硕士学位授权点，下设“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“检测技术与自动化装置”、“导航制导与控制”、“系统工程”等5个二级学科博士、硕士学位授权点，其中“控制理论与控制工程”为国家重点学科，建有“控制科学与工程”一级学科博士后流动站和长江学者特聘教授岗位。
学院拥有一流的师资队伍，著名控制科学家钱钟韩院士、冯纯伯院士曾长期在学院任教，费爱国院士兼任现任院长。现有教职员工100人，其中教授/研究员 26 人，副教授/副研究员 31人。博士研究生导师39人。学院现有中国工程院院士1人，俄罗斯自然科学院院士1人，国家自然科学基金创新群体1个，国家杰出青年基金获得者4人，IEEE Fellow 2人，其他国家级人才8人，省部级人才37人。
学院设有“自动化”、“机器人工程”2个本科专业，其中“机器人工程”专业于2016年建立，为我国最早设立的“机器人工程”专业（当年全国唯一），首届毕业生升学率达到85%以上。2019年“自动化”专业入选全国首批一流本科专业建设点，2021年“机器人工程”专业入选全国一流本科专业建设点（当年全国唯一）。学院是教育部自动化教指委“自动化专业发展战略研究”核心成员，国家首批一类特色专业，教育部卓越工程师计划首批试点专业，也是江苏省首批品牌专业和首批重点专业，并牵头建设国家级人才培养模式创新试验区。学院拥有国家教学团队1个，国家教学名师1人，建有国家级精品课程和一流课程5门。现有全日制在校生1300余人，其中研究生占50%以上。另外，在无锡国际校区招收“电子信息”专业研究生。学院毕业生适应性强、应用面广，是全校热门品牌专业之一，在学界、政界、商界成绩突出，相继涌现了一大批的杰出人才与社会精英，为社会与经济发展提供强大的技术支撑与智力支持。
学院积极服务国家重大战略需求，围绕智能机器人、工业控制、人工智能等领域重点开展科技攻关。设有“复杂工程系统测量与控制”教育部重点实验室。承担了一批国家级和省部级基础研究和科技攻关项目，在网络控制、智能控制、集群控制、极地科考等领域已取得具有国际水平的研究成果，SCI、EI论文收录均列全国前列，在国际和国内控制界具有较大影响。近年来，先后获得国家级科技奖励3项，省部级一等奖8项、二等奖数十项。坚持产学研结合，近五年，科研经费到款年均增长20%以上，发明专利申请和授权量逐年攀升。
学院与帝国理工学院、波士顿大学等一批世界一流大学建立长期合作关系，有十余位国外著名学者受聘为学院客座教授。多次成功举办重要国际学术会议和暑期学校，每年选派若干优秀学生赴海外交流与联合培养，资助学生参加国际学术会议与学科竞赛。
昂首开启新征程，奋进续写新华章。自动化学院将坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，秉承和践行学校“止于至善”校训，开拓进取，求实创新，全面深化学院各项改革，努力实现事业发展新的重大突破，为学校的“双一流”建设、为实现中华民族伟大复兴的中国梦做出积极贡献。
