自动化学院历史悠久，底蕴深厚，前身可追溯至1923年国立东南大学电机工程系。学校于1957年筹建自动控制系，1962年正式成立挂牌招生，是我国最早设立自动化专业的院系之一。为适应学科发展，1973年，东南大学动力系“工业电气自动化”专业并入自动控制系，1981年本系“电子计算机”专业分出成立计算机科学与工程系，1987年系统工程研究室分出与校内其他系科合并成立经济管理系，1992年“精密仪器”专业和“检测技术及仪器”专业分出成立了仪器科学与工程系。
学院是国家“985工程”和“211工程”建设重点支持单位。2017年入选国家首批“双一流”建设学科，2022年再次入选“双一流”建设学科名单，在第四轮全国学科评估中获评A类。设有“控制科学与工程”一级学科博士、硕士学位授权点，下设“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“检测技术与自动化装置”、“导航制导与控制”、“系统工程”等5个二级学科博士、硕士学位授权点，其中“控制理论与控制工程”为国家重点学科，建有“控制科学与工程”一级学科博士后流动站和长江学者特聘教授岗位。
学院拥有一流的师资队伍，著名控制科学家钱钟韩院士、冯纯伯院士曾长期在学院任教，费爱国院士兼任现任院长。现有教职员工100人，其中教授/研究员 26 人，副教授/副研究员 31人。博士研究生导师39人。学院现有中国工程院院士1人，俄罗斯自然科学院院士1人，国家自然科学基金创新群体1个，国家杰出青年基金获得者4人，IEEE Fellow 2人，其他国家级人才8人，省部级人才37人。
学院设有“自动化”、“机器人工程”2个本科专业，其中“机器人工程”专业于2016年建立，为我国最早设立的“机器人工程”专业（当年全国唯一），首届毕业生升学率达到85%以上。2019年“自动化”专业入选全国首批一流本科专业建设点，2021年“机器人工程”专业入选全国一流本科专业建设点（当年全国唯一）。学院是教育部自动化教指委“自动化专业发展战略研究”核心成员，国家首批一类特色专业，教育部卓越工程师计划首批试点专业，也是江苏省首批品牌专业和首批重点专业，并牵头建设国家级人才培养模式创新试验区。学院拥有国家教学团队1个，国家教学名师1人，建有国家级精品课程和一流课程5门。现有全日制在校生1300余人，其中研究生占50%以上。另外，在无锡国际校区招收“电子信息”专业研究生。学院毕业生适应性强、应用面广，是全校热门品牌专业之一，在学界、政界、商界成绩突出，相继涌现了一大批的杰出人才与社会精英，为社会与经济发展提供强大的技术支撑与智力支持。
学院积极服务国家重大战略需求，围绕智能机器人、工业控制、人工智能等领域重点开展科技攻关。设有“复杂工程系统测量与控制”教育部重点实验室。承担了一批国家级和省部级基础研究和科技攻关项目，在网络控制、智能控制、集群控制、极地科考等领域已取得具有国际水平的研究成果，SCI、EI论文收录均列全国前列，在国际和国内控制界具有较大影响。近年来，先后获得国家级科技奖励3项，省部级一等奖8项、二等奖数十项。坚持产学研结合，近五年，科研经费到款年均增长20%以上，发明专利申请和授权量逐年攀升。
学院与帝国理工学院、波士顿大学等一批世界一流大学建立长期合作关系，有十余位国外著名学者受聘为学院客座教授。多次成功举办重要国际学术会议和暑期学校，每年选派若干优秀学生赴海外交流与联合培养，资助学生参加国际学术会议与学科竞赛。
昂首开启新征程，奋进续写新华章。自动化学院将坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，秉承和践行学校“止于至善”校训，开拓进取，求实创新，全面深化学院各项改革，努力实现事业发展新的重大突破，为学校的“双一流”建设、为实现中华民族伟大复兴的中国梦做出积极贡献。
- 费爱国院长（兼职）
中国工程院院士，教授，博士生导师。
1955年7月7日出生，汉族，江苏省涟水县人，中共党员，中国工程院院士。军事指挥信息系统和数据链专家。1981年硕士毕业于北京邮电学院，2004年于北京科技大学获工学博士学位。现任空军研究院研究员，中国指挥与控制学会理事长、军队网信专家委委员，军委科技委网信领域专家组副组长。获国家科技进步一等奖1项、二等奖2项，军队科技进步一等奖6项。编著出版8部著作。曾获全国优秀科技工作者、军队科技领军人才、何梁何利基金科学与技术进步奖、中国科协“求是”杰出青年实用工程奖。享受政府特殊津贴。2013年当选中国工程院院士。工作分工：发展规划、资源调配、对外交流合作
- 金立左党委书记
- 魏海坤执行院长
- 现为东南大学自动化学院执行院长，教授，博士生导师。
1997年、2000年于东南大学自动化所分获工学硕士、博士学位，同年留校工作；
2005 年至2007 年在日本理化学研究所脑科学研究中心 (RIKEN BSI)师从Shun-ich Amari教授从事博士后研究。主持研制了我国首套南极科考支撑平台；2010年作为中国第27次南极科考队内陆队队员，赴南极中山站和昆仑站参加科考工作，完成了平台在昆仑站的现场调试和投运。
工作分工：配合院长(兼职)负责院全面工作，分管学科建设、人事、财务、校友工作
- 李世华副院长
- 李世华教授，1975年生，自动化学院副院长，研究领域为机电系统建模、分析与控制，非光滑控制，抗抗扰控制等。现为IEEE Fellow，IEEE CSS非线性系统控制、变结构与滑模控制、系统辨识与自适应控制三个技术委员会委员、IEEE IES运动控制、电机两个技术委员会委员。
担任Int.Robust Nonlinear Control、Int.J.Control Autom Syst、IET Power Eletron、Int.J.Election、J.Power Elctron等国际刊物编委。 主持科研项目20余项，其中973子课题1项、国家自然科学基金3项、教育部新世纪优秀人才计划项目1项、江苏省杰出青年基金1项、省333高层次人才培养工程1项、省六大人才高峰项目1项、航空科学基金3项；与企业联合完成国家863重大项目1项（校内负责人）。
工作分工：分管研究生教育教学
- 东南大学模式识别与智能系统专业工学博士，日本东京大学生产技术研究所博士后，东南大学自动化学院副院长，中国航空学会信息融合分会委员，国内某国防重点实验室客座研究员。
主要研究方向为机器视觉、模式识别、机器学习、信息融合与嵌入式系统。主持国家级、省部级、国防科技、企业委托课题10余项。
在国内外核心期刊与国际学术会议上发表论文50余篇， SCI/EI收录论文30余篇，编著专论4部、教材1部、专利3件。承担博士课程《计算机视觉》、硕士课程《统计学习》、本科课程《多媒体技术》教学工作。指导博士6名、硕士30余名，指导本科毕业论文多次获江苏省优秀论文奖。
工作分工：分管科研工作
金立左副院长（兼）
- 东南大学模式识别与智能系统专业工学博士，日本东京大学生产技术研究所博士后，东南大学自动化学院副院长，中国航空学会信息融合分会委员，国内某国防重点实验室客座研究员。
- 张亚副院长
- 1981年生，江苏常州人，工学博士，教授，博士生导师。
研究方向包括传感器网络、多智能体系统、网络安全，学习控制等方面。发表论文60余篇，论文他引500余次， 2008年入围关肇直奖。担任Automatica、IEEE Transactions on Automatic Control、System & Control Letters、自动化学报、中国科学等多个国内、国际期刊的审稿人。博士学位论文被评为“2011 年东南大学优秀博士学位论文”，获得东南大学青年教师授课竞赛三等奖、“常州市人民政府奖教金”，菲尼克斯电气--东南大学奖励金一等奖。2017年入选江苏省“六大人才高峰”高层次人才选拔培养资助计划，2015年入选东南大学优秀青年教师资助计划。
工作分工：分管本科生教育教学、学院本科实验室、实验设备
- 赵剑锋副书记、副院长（兼）
系/学科组 系主任/学科组长 自动化系 杨俊 机器人系 周波 控制理论与控制工程学科组 翟军勇 模式识别与智能系统 夏思宇 检测技术与自动化装置 陈夕松 系统工程 汪峥 导航、制导与控制 曹向辉
